Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBAP2Q5T6F2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBAP2Q5T6F2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBAP2Q5T6F2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms