Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5J6

SWT1, Transcriptional protein SWT1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWT1Q5T5J6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWT1Q5T5J6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SWT1Q5T5J6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWT1Q5T5J6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SWT1Q5T5J6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms