Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PPM1JQ5JR12 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPM1JQ5JR12 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPM1JQ5JR12 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPM1JQ5JR12 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPM1JQ5JR12 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPM1JQ5JR12 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPM1JQ5JR12 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPM1JQ5JR12 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPM1JQ5JR12 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPM1JQ5JR12 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPM1JQ5JR12 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPM1JQ5JR12 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPM1JQ5JR12 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPM1JQ5JR12 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1JQ5JR12 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPM1JQ5JR12 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPM1JQ5JR12 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PPM1JQ5JR12 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms