Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRRT3Q5FWE3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRRT3Q5FWE3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRRT3Q5FWE3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms