Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCAF6Q58WW2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCAF6Q58WW2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCAF6Q58WW2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCAF6Q58WW2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCAF6Q58WW2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCAF6Q58WW2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCAF6Q58WW2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCAF6Q58WW2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCAF6Q58WW2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCAF6Q58WW2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCAF6Q58WW2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DCAF6Q58WW2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCAF6Q58WW2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DCAF6Q58WW2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DCAF6Q58WW2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DCAF6Q58WW2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms