Protein–RNA interactions for Protein: Q53TQ3

INO80D, INO80 complex subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80DQ53TQ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
INO80DQ53TQ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80DQ53TQ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
INO80DQ53TQ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INO80DQ53TQ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INO80DQ53TQ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 291.7 ms