Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDNFQ49AH0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDNFQ49AH0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDNFQ49AH0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDNFQ49AH0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDNFQ49AH0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDNFQ49AH0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDNFQ49AH0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDNFQ49AH0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDNFQ49AH0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDNFQ49AH0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDNFQ49AH0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDNFQ49AH0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDNFQ49AH0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDNFQ49AH0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDNFQ49AH0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDNFQ49AH0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDNFQ49AH0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDNFQ49AH0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDNFQ49AH0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDNFQ49AH0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms