Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ13

WDR72, WD repeat-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR72Q3MJ13 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
WDR72Q3MJ13 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
WDR72Q3MJ13 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
WDR72Q3MJ13 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR72Q3MJ13 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR72Q3MJ13 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR72Q3MJ13 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR72Q3MJ13 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR72Q3MJ13 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR72Q3MJ13 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR72Q3MJ13 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
WDR72Q3MJ13 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
WDR72Q3MJ13 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
WDR72Q3MJ13 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
WDR72Q3MJ13 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR72Q3MJ13 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms