Protein–RNA interactions for Protein: Q3LXA3

TKFC, Triokinase/FMN cyclase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TKFCQ3LXA3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TKFCQ3LXA3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TKFCQ3LXA3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TKFCQ3LXA3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TKFCQ3LXA3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TKFCQ3LXA3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TKFCQ3LXA3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TKFCQ3LXA3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TKFCQ3LXA3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TKFCQ3LXA3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TKFCQ3LXA3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms