Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms