Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CSPP1Q1MSJ5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSPP1Q1MSJ5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CSPP1Q1MSJ5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CSPP1Q1MSJ5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CSPP1Q1MSJ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CSPP1Q1MSJ5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CSPP1Q1MSJ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSPP1Q1MSJ5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSPP1Q1MSJ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSPP1Q1MSJ5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSPP1Q1MSJ5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSPP1Q1MSJ5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSPP1Q1MSJ5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSPP1Q1MSJ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CSPP1Q1MSJ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CSPP1Q1MSJ5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSPP1Q1MSJ5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CSPP1Q1MSJ5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSPP1Q1MSJ5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms