Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
COL24A1Q17RW2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
COL24A1Q17RW2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
COL24A1Q17RW2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
COL24A1Q17RW2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
COL24A1Q17RW2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
COL24A1Q17RW2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
COL24A1Q17RW2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
COL24A1Q17RW2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
COL24A1Q17RW2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
COL24A1Q17RW2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
COL24A1Q17RW2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
COL24A1Q17RW2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
COL24A1Q17RW2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
COL24A1Q17RW2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
COL24A1Q17RW2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
COL24A1Q17RW2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
COL24A1Q17RW2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
COL24A1Q17RW2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
COL24A1Q17RW2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
COL24A1Q17RW2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
COL24A1Q17RW2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
COL24A1Q17RW2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms