Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STX1AQ16623 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STX1AQ16623 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
STX1AQ16623 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STX1AQ16623 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STX1AQ16623 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STX1AQ16623 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28■■■□□ 2.07
STX1AQ16623 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
STX1AQ16623 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STX1AQ16623 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STX1AQ16623 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STX1AQ16623 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STX1AQ16623 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STX1AQ16623 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STX1AQ16623 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STX1AQ16623 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STX1AQ16623 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STX1AQ16623 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
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