Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC18A3Q16572 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC18A3Q16572 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC18A3Q16572 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC18A3Q16572 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms