Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNXAQ16473 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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TNXAQ16473 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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TNXAQ16473 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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TNXAQ16473 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNXAQ16473 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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TNXAQ16473 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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TNXAQ16473 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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TNXAQ16473 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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TNXAQ16473 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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TNXAQ16473 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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TNXAQ16473 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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TNXAQ16473 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNXAQ16473 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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