Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ALX1Q15699 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ALX1Q15699 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ALX1Q15699 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
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