Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SURF1Q15526 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SURF1Q15526 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SURF1Q15526 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SURF1Q15526 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SURF1Q15526 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
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