Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NKX1-1Q15270 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NKX1-1Q15270 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NKX1-1Q15270 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NKX1-1Q15270 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NKX1-1Q15270 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NKX1-1Q15270 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
NKX1-1Q15270 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NKX1-1Q15270 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NKX1-1Q15270 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NKX1-1Q15270 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NKX1-1Q15270 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NKX1-1Q15270 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NKX1-1Q15270 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NKX1-1Q15270 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NKX1-1Q15270 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NKX1-1Q15270 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NKX1-1Q15270 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NKX1-1Q15270 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NKX1-1Q15270 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NKX1-1Q15270 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NKX1-1Q15270 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NKX1-1Q15270 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NKX1-1Q15270 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NKX1-1Q15270 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
NKX1-1Q15270 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NKX1-1Q15270 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NKX1-1Q15270 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NKX1-1Q15270 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NKX1-1Q15270 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NKX1-1Q15270 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NKX1-1Q15270 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NKX1-1Q15270 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NKX1-1Q15270 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NKX1-1Q15270 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
NKX1-1Q15270 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NKX1-1Q15270 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NKX1-1Q15270 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NKX1-1Q15270 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NKX1-1Q15270 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
NKX1-1Q15270 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NKX1-1Q15270 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NKX1-1Q15270 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NKX1-1Q15270 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
NKX1-1Q15270 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
NKX1-1Q15270 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NKX1-1Q15270 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NKX1-1Q15270 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
NKX1-1Q15270 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NKX1-1Q15270 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NKX1-1Q15270 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NKX1-1Q15270 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
NKX1-1Q15270 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NKX1-1Q15270 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NKX1-1Q15270 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NKX1-1Q15270 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NKX1-1Q15270 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NKX1-1Q15270 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NKX1-1Q15270 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NKX1-1Q15270 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NKX1-1Q15270 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms