Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKD1Q15139 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKD1Q15139 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKD1Q15139 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
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