Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPIDRQ14159 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPIDRQ14159 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
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