Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CKAP5Q14008 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CKAP5Q14008 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKAP5Q14008 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKAP5Q14008 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
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