Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NEUROD1Q13562 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NEUROD1Q13562 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NEUROD1Q13562 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NEUROD1Q13562 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
NEUROD1Q13562 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
NEUROD1Q13562 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NEUROD1Q13562 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NEUROD1Q13562 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NEUROD1Q13562 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NEUROD1Q13562 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NEUROD1Q13562 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NEUROD1Q13562 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NEUROD1Q13562 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NEUROD1Q13562 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NEUROD1Q13562 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
NEUROD1Q13562 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NEUROD1Q13562 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
NEUROD1Q13562 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NEUROD1Q13562 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NEUROD1Q13562 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NEUROD1Q13562 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NEUROD1Q13562 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NEUROD1Q13562 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
NEUROD1Q13562 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NEUROD1Q13562 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NEUROD1Q13562 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NEUROD1Q13562 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NEUROD1Q13562 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NEUROD1Q13562 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NEUROD1Q13562 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NEUROD1Q13562 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NEUROD1Q13562 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
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