Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf61Q13536 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C1orf61Q13536 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf61Q13536 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
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