Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRQ13535 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRQ13535 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRQ13535 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRQ13535 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRQ13535 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRQ13535 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRQ13535 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATRQ13535 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATRQ13535 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ATRQ13535 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATRQ13535 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATRQ13535 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ATRQ13535 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRQ13535 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRQ13535 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRQ13535 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRQ13535 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRQ13535 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRQ13535 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRQ13535 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRQ13535 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRQ13535 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRQ13535 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRQ13535 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRQ13535 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRQ13535 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRQ13535 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRQ13535 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRQ13535 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRQ13535 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRQ13535 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRQ13535 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRQ13535 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRQ13535 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRQ13535 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRQ13535 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRQ13535 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRQ13535 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRQ13535 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRQ13535 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRQ13535 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRQ13535 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRQ13535 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRQ13535 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRQ13535 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRQ13535 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRQ13535 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRQ13535 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRQ13535 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRQ13535 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRQ13535 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRQ13535 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRQ13535 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRQ13535 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRQ13535 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRQ13535 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRQ13535 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRQ13535 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRQ13535 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRQ13535 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRQ13535 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRQ13535 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATRQ13535 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRQ13535 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRQ13535 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATRQ13535 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRQ13535 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATRQ13535 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRQ13535 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRQ13535 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRQ13535 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRQ13535 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRQ13535 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRQ13535 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRQ13535 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRQ13535 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATRQ13535 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ATRQ13535 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRQ13535 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRQ13535 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRQ13535 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATRQ13535 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRQ13535 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRQ13535 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRQ13535 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRQ13535 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRQ13535 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATRQ13535 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRQ13535 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATRQ13535 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRQ13535 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRQ13535 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRQ13535 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRQ13535 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATRQ13535 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRQ13535 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRQ13535 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRQ13535 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATRQ13535 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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