Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCGB2A2Q13296 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCGB2A2Q13296 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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SCGB2A2Q13296 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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SCGB2A2Q13296 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCGB2A2Q13296 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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