Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FOXC1Q12948 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXC1Q12948 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXC1Q12948 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXC1Q12948 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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