Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BPTFQ12830 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BPTFQ12830 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BPTFQ12830 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPTFQ12830 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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