Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC3A1Q07837 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC3A1Q07837 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC3A1Q07837 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms