Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.13■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
COL16A1Q07092 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
COL16A1Q07092 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
COL16A1Q07092 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
COL16A1Q07092 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
COL16A1Q07092 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
COL16A1Q07092 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
COL16A1Q07092 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
COL16A1Q07092 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
COL16A1Q07092 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
COL16A1Q07092 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
COL16A1Q07092 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
COL16A1Q07092 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
COL16A1Q07092 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
COL16A1Q07092 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.07■■■■□ 3.21
COL16A1Q07092 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.07■■■■□ 3.21
COL16A1Q07092 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
COL16A1Q07092 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
COL16A1Q07092 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
COL16A1Q07092 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
COL16A1Q07092 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.19
COL16A1Q07092 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
COL16A1Q07092 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
COL16A1Q07092 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
COL16A1Q07092 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35■■■■□ 3.19
COL16A1Q07092 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
COL16A1Q07092 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
COL16A1Q07092 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
COL16A1Q07092 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
COL16A1Q07092 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
COL16A1Q07092 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
COL16A1Q07092 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
COL16A1Q07092 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
COL16A1Q07092 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
COL16A1Q07092 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
COL16A1Q07092 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
COL16A1Q07092 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
COL16A1Q07092 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
COL16A1Q07092 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
COL16A1Q07092 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
COL16A1Q07092 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms