Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGR3Q06889 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGR3Q06889 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGR3Q06889 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EGR3Q06889 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EGR3Q06889 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms