Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPN11Q06124 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN11Q06124 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PTPN11Q06124 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN11Q06124 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN11Q06124 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN11Q06124 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN11Q06124 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN11Q06124 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN11Q06124 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN11Q06124 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN11Q06124 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN11Q06124 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN11Q06124 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN11Q06124 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN11Q06124 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN11Q06124 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPN11Q06124 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN11Q06124 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms