Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNFAIP2Q03169 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TNFAIP2Q03169 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNFAIP2Q03169 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TNFAIP2Q03169 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNFAIP2Q03169 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNFAIP2Q03169 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNFAIP2Q03169 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNFAIP2Q03169 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNFAIP2Q03169 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNFAIP2Q03169 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNFAIP2Q03169 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TNFAIP2Q03169 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TNFAIP2Q03169 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNFAIP2Q03169 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNFAIP2Q03169 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TNFAIP2Q03169 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNFAIP2Q03169 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFAIP2Q03169 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFAIP2Q03169 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFAIP2Q03169 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFAIP2Q03169 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFAIP2Q03169 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNFAIP2Q03169 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFAIP2Q03169 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFAIP2Q03169 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNFAIP2Q03169 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TNFAIP2Q03169 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TNFAIP2Q03169 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNFAIP2Q03169 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms