Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MUC3AQ02505 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MUC3AQ02505 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MUC3AQ02505 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MUC3AQ02505 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MUC3AQ02505 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MUC3AQ02505 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MUC3AQ02505 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MUC3AQ02505 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MUC3AQ02505 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MUC3AQ02505 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MUC3AQ02505 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MUC3AQ02505 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MUC3AQ02505 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms