Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SP3Q02447 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SP3Q02447 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SP3Q02447 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SP3Q02447 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SP3Q02447 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SP3Q02447 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SP3Q02447 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SP3Q02447 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SP3Q02447 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SP3Q02447 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SP3Q02447 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SP3Q02447 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SP3Q02447 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SP3Q02447 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SP3Q02447 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SP3Q02447 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SP3Q02447 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SP3Q02447 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SP3Q02447 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SP3Q02447 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SP3Q02447 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SP3Q02447 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SP3Q02447 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SP3Q02447 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SP3Q02447 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SP3Q02447 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SP3Q02447 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SP3Q02447 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SP3Q02447 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SP3Q02447 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SP3Q02447 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SP3Q02447 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SP3Q02447 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SP3Q02447 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SP3Q02447 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SP3Q02447 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SP3Q02447 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SP3Q02447 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SP3Q02447 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SP3Q02447 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SP3Q02447 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SP3Q02447 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SP3Q02447 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SP3Q02447 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SP3Q02447 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SP3Q02447 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SP3Q02447 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SP3Q02447 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SP3Q02447 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SP3Q02447 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SP3Q02447 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SP3Q02447 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SP3Q02447 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SP3Q02447 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SP3Q02447 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SP3Q02447 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SP3Q02447 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SP3Q02447 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SP3Q02447 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SP3Q02447 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SP3Q02447 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SP3Q02447 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SP3Q02447 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SP3Q02447 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SP3Q02447 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SP3Q02447 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SP3Q02447 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SP3Q02447 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SP3Q02447 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SP3Q02447 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SP3Q02447 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SP3Q02447 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SP3Q02447 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SP3Q02447 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SP3Q02447 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SP3Q02447 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SP3Q02447 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SP3Q02447 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SP3Q02447 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SP3Q02447 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SP3Q02447 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SP3Q02447 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SP3Q02447 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SP3Q02447 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SP3Q02447 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SP3Q02447 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SP3Q02447 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SP3Q02447 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SP3Q02447 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SP3Q02447 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SP3Q02447 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SP3Q02447 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SP3Q02447 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SP3Q02447 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SP3Q02447 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SP3Q02447 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SP3Q02447 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SP3Q02447 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SP3Q02447 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.7 ms