Protein–RNA interactions for Protein: Q02221

COX6A2, Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A2Q02221 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A2Q02221 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COX6A2Q02221 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COX6A2Q02221 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms