Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPIBQ01892 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPIBQ01892 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPIBQ01892 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms