Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX1Q01196 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX1Q01196 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms