Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
B4GALNT1Q00973 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
B4GALNT1Q00973 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4GALNT1Q00973 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.9 ms