Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VLDLRP98155 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VLDLRP98155 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VLDLRP98155 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VLDLRP98155 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms