Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CRB1P82279 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CRB1P82279 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CRB1P82279 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CRB1P82279 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CRB1P82279 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CRB1P82279 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CRB1P82279 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CRB1P82279 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CRB1P82279 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CRB1P82279 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CRB1P82279 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34■■■■□ 3.03
CRB1P82279 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CRB1P82279 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CRB1P82279 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CRB1P82279 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CRB1P82279 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CRB1P82279 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CRB1P82279 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CRB1P82279 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CRB1P82279 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CRB1P82279 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CRB1P82279 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CRB1P82279 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CRB1P82279 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CRB1P82279 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CRB1P82279 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CRB1P82279 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CRB1P82279 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CRB1P82279 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CRB1P82279 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CRB1P82279 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CRB1P82279 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CRB1P82279 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CRB1P82279 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CRB1P82279 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CRB1P82279 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CRB1P82279 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CRB1P82279 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CRB1P82279 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CRB1P82279 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CRB1P82279 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CRB1P82279 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CRB1P82279 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CRB1P82279 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CRB1P82279 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CRB1P82279 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CRB1P82279 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CRB1P82279 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CRB1P82279 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CRB1P82279 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CRB1P82279 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CRB1P82279 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CRB1P82279 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CRB1P82279 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CRB1P82279 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CRB1P82279 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CRB1P82279 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CRB1P82279 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CRB1P82279 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CRB1P82279 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CRB1P82279 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CRB1P82279 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CRB1P82279 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CRB1P82279 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CRB1P82279 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CRB1P82279 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CRB1P82279 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CRB1P82279 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CRB1P82279 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CRB1P82279 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CRB1P82279 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CRB1P82279 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CRB1P82279 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CRB1P82279 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CRB1P82279 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CRB1P82279 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CRB1P82279 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CRB1P82279 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CRB1P82279 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CRB1P82279 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CRB1P82279 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CRB1P82279 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CRB1P82279 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CRB1P82279 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CRB1P82279 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CRB1P82279 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CRB1P82279 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CRB1P82279 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CRB1P82279 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CRB1P82279 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CRB1P82279 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CRB1P82279 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CRB1P82279 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CRB1P82279 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CRB1P82279 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CRB1P82279 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CRB1P82279 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CRB1P82279 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CRB1P82279 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms