Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCS1P62166 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCS1P62166 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCS1P62166 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCS1P62166 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCS1P62166 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCS1P62166 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCS1P62166 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCS1P62166 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCS1P62166 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCS1P62166 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NCS1P62166 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCS1P62166 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCS1P62166 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCS1P62166 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCS1P62166 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCS1P62166 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCS1P62166 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCS1P62166 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCS1P62166 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NCS1P62166 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCS1P62166 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCS1P62166 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCS1P62166 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCS1P62166 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCS1P62166 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCS1P62166 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCS1P62166 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCS1P62166 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCS1P62166 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCS1P62166 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCS1P62166 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCS1P62166 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCS1P62166 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCS1P62166 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCS1P62166 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCS1P62166 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCS1P62166 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCS1P62166 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCS1P62166 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCS1P62166 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCS1P62166 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCS1P62166 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NCS1P62166 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCS1P62166 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCS1P62166 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCS1P62166 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCS1P62166 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCS1P62166 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCS1P62166 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCS1P62166 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCS1P62166 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCS1P62166 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCS1P62166 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCS1P62166 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCS1P62166 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCS1P62166 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCS1P62166 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCS1P62166 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCS1P62166 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCS1P62166 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NCS1P62166 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCS1P62166 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCS1P62166 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCS1P62166 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCS1P62166 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NCS1P62166 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCS1P62166 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCS1P62166 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCS1P62166 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCS1P62166 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCS1P62166 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCS1P62166 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCS1P62166 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCS1P62166 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCS1P62166 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCS1P62166 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCS1P62166 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCS1P62166 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCS1P62166 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCS1P62166 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCS1P62166 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCS1P62166 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCS1P62166 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCS1P62166 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCS1P62166 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NCS1P62166 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCS1P62166 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCS1P62166 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCS1P62166 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCS1P62166 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCS1P62166 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCS1P62166 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCS1P62166 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NCS1P62166 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NCS1P62166 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NCS1P62166 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCS1P62166 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCS1P62166 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCS1P62166 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms