Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1BP61266 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1BP61266 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1BP61266 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1BP61266 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1BP61266 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX1BP61266 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STX1BP61266 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX1BP61266 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STX1BP61266 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STX1BP61266 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX1BP61266 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX1BP61266 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX1BP61266 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX1BP61266 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1BP61266 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX1BP61266 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX1BP61266 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX1BP61266 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX1BP61266 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX1BP61266 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STX1BP61266 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX1BP61266 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STX1BP61266 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX1BP61266 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX1BP61266 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX1BP61266 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STX1BP61266 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX1BP61266 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX1BP61266 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STX1BP61266 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1BP61266 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1BP61266 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1BP61266 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1BP61266 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1BP61266 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1BP61266 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1BP61266 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1BP61266 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX1BP61266 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1BP61266 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1BP61266 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1BP61266 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1BP61266 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1BP61266 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1BP61266 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX1BP61266 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX1BP61266 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX1BP61266 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX1BP61266 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX1BP61266 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX1BP61266 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX1BP61266 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX1BP61266 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX1BP61266 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STX1BP61266 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX1BP61266 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
STX1BP61266 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX1BP61266 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX1BP61266 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX1BP61266 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
STX1BP61266 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX1BP61266 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX1BP61266 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX1BP61266 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX1BP61266 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX1BP61266 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1BP61266 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1BP61266 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1BP61266 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1BP61266 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1BP61266 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1BP61266 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1BP61266 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1BP61266 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1BP61266 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX1BP61266 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX1BP61266 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX1BP61266 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX1BP61266 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX1BP61266 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX1BP61266 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX1BP61266 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX1BP61266 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX1BP61266 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX1BP61266 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX1BP61266 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STX1BP61266 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STX1BP61266 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STX1BP61266 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX1BP61266 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX1BP61266 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1BP61266 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1BP61266 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1BP61266 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1BP61266 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1BP61266 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1BP61266 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1BP61266 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1BP61266 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms