Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00315P59091 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00315P59091 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00315P59091 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms