Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF3P57682 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF3P57682 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF3P57682 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF3P57682 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF3P57682 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF3P57682 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF3P57682 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF3P57682 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF3P57682 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF3P57682 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF3P57682 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF3P57682 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF3P57682 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF3P57682 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF3P57682 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF3P57682 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF3P57682 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF3P57682 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF3P57682 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF3P57682 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF3P57682 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF3P57682 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF3P57682 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF3P57682 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF3P57682 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF3P57682 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF3P57682 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF3P57682 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF3P57682 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF3P57682 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF3P57682 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF3P57682 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF3P57682 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF3P57682 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLF3P57682 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF3P57682 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF3P57682 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF3P57682 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLF3P57682 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF3P57682 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF3P57682 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF3P57682 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF3P57682 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLF3P57682 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF3P57682 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF3P57682 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF3P57682 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF3P57682 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF3P57682 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF3P57682 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLF3P57682 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF3P57682 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF3P57682 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF3P57682 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF3P57682 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLF3P57682 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF3P57682 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF3P57682 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF3P57682 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF3P57682 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF3P57682 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF3P57682 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF3P57682 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF3P57682 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLF3P57682 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF3P57682 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF3P57682 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF3P57682 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF3P57682 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLF3P57682 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF3P57682 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLF3P57682 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF3P57682 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF3P57682 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF3P57682 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLF3P57682 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF3P57682 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF3P57682 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF3P57682 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF3P57682 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF3P57682 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLF3P57682 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF3P57682 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF3P57682 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF3P57682 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF3P57682 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLF3P57682 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF3P57682 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF3P57682 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF3P57682 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF3P57682 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF3P57682 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF3P57682 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLF3P57682 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF3P57682 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF3P57682 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF3P57682 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF3P57682 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF3P57682 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms