Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC8A3P57103 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC8A3P57103 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC8A3P57103 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms