Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRG3P56975 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NRG3P56975 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NRG3P56975 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NRG3P56975 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRG3P56975 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRG3P56975 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRG3P56975 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRG3P56975 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRG3P56975 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRG3P56975 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRG3P56975 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRG3P56975 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRG3P56975 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRG3P56975 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRG3P56975 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRG3P56975 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRG3P56975 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRG3P56975 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRG3P56975 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRG3P56975 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRG3P56975 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRG3P56975 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRG3P56975 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRG3P56975 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRG3P56975 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRG3P56975 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRG3P56975 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRG3P56975 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRG3P56975 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRG3P56975 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRG3P56975 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRG3P56975 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRG3P56975 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NRG3P56975 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRG3P56975 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRG3P56975 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRG3P56975 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRG3P56975 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NRG3P56975 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NRG3P56975 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NRG3P56975 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NRG3P56975 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRG3P56975 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRG3P56975 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRG3P56975 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRG3P56975 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRG3P56975 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRG3P56975 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRG3P56975 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRG3P56975 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRG3P56975 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRG3P56975 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRG3P56975 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRG3P56975 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRG3P56975 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRG3P56975 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRG3P56975 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRG3P56975 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRG3P56975 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRG3P56975 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRG3P56975 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRG3P56975 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NRG3P56975 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRG3P56975 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRG3P56975 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRG3P56975 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRG3P56975 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRG3P56975 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRG3P56975 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRG3P56975 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRG3P56975 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRG3P56975 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NRG3P56975 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRG3P56975 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRG3P56975 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRG3P56975 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRG3P56975 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NRG3P56975 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRG3P56975 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRG3P56975 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRG3P56975 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRG3P56975 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRG3P56975 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRG3P56975 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRG3P56975 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRG3P56975 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRG3P56975 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRG3P56975 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRG3P56975 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRG3P56975 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRG3P56975 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRG3P56975 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRG3P56975 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRG3P56975 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRG3P56975 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRG3P56975 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRG3P56975 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRG3P56975 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NRG3P56975 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms