Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNU13P55769 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNU13P55769 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNU13P55769 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNU13P55769 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNU13P55769 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNU13P55769 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNU13P55769 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNU13P55769 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNU13P55769 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNU13P55769 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNU13P55769 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNU13P55769 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNU13P55769 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNU13P55769 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNU13P55769 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNU13P55769 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNU13P55769 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNU13P55769 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNU13P55769 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNU13P55769 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNU13P55769 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNU13P55769 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNU13P55769 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNU13P55769 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNU13P55769 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNU13P55769 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNU13P55769 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNU13P55769 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNU13P55769 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNU13P55769 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNU13P55769 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNU13P55769 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNU13P55769 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNU13P55769 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNU13P55769 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNU13P55769 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNU13P55769 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNU13P55769 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNU13P55769 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNU13P55769 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNU13P55769 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNU13P55769 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNU13P55769 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNU13P55769 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNU13P55769 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNU13P55769 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNU13P55769 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNU13P55769 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNU13P55769 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNU13P55769 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNU13P55769 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNU13P55769 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNU13P55769 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNU13P55769 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNU13P55769 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNU13P55769 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNU13P55769 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNU13P55769 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNU13P55769 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNU13P55769 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNU13P55769 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNU13P55769 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNU13P55769 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNU13P55769 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNU13P55769 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNU13P55769 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNU13P55769 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNU13P55769 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNU13P55769 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNU13P55769 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNU13P55769 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNU13P55769 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNU13P55769 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNU13P55769 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNU13P55769 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNU13P55769 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNU13P55769 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNU13P55769 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNU13P55769 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNU13P55769 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNU13P55769 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNU13P55769 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNU13P55769 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNU13P55769 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNU13P55769 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNU13P55769 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNU13P55769 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNU13P55769 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNU13P55769 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNU13P55769 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNU13P55769 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNU13P55769 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNU13P55769 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNU13P55769 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNU13P55769 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNU13P55769 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNU13P55769 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNU13P55769 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNU13P55769 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms