Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKAA2P54646 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAA2P54646 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAA2P54646 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAA2P54646 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms