Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK2P51955 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK2P51955 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK2P51955 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK2P51955 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK2P51955 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK2P51955 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK2P51955 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK2P51955 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK2P51955 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK2P51955 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK2P51955 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK2P51955 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK2P51955 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK2P51955 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK2P51955 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK2P51955 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK2P51955 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK2P51955 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK2P51955 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK2P51955 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK2P51955 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK2P51955 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK2P51955 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK2P51955 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK2P51955 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK2P51955 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK2P51955 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK2P51955 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK2P51955 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK2P51955 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK2P51955 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK2P51955 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK2P51955 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK2P51955 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK2P51955 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK2P51955 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK2P51955 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK2P51955 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK2P51955 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK2P51955 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK2P51955 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK2P51955 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK2P51955 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK2P51955 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK2P51955 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK2P51955 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK2P51955 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK2P51955 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK2P51955 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK2P51955 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK2P51955 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK2P51955 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK2P51955 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK2P51955 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK2P51955 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK2P51955 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK2P51955 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK2P51955 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK2P51955 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK2P51955 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK2P51955 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK2P51955 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK2P51955 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK2P51955 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK2P51955 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK2P51955 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK2P51955 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK2P51955 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK2P51955 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK2P51955 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK2P51955 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK2P51955 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK2P51955 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK2P51955 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK2P51955 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK2P51955 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK2P51955 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK2P51955 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK2P51955 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK2P51955 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK2P51955 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK2P51955 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK2P51955 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK2P51955 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK2P51955 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK2P51955 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK2P51955 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK2P51955 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK2P51955 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK2P51955 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK2P51955 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK2P51955 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK2P51955 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK2P51955 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK2P51955 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK2P51955 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK2P51955 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK2P51955 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK2P51955 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms