Protein–RNA interactions for Protein: P51677

CCR3, C-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR3P51677 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCR3P51677 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCR3P51677 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCR3P51677 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCR3P51677 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCR3P51677 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCR3P51677 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCR3P51677 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCR3P51677 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCR3P51677 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCR3P51677 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCR3P51677 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCR3P51677 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCR3P51677 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCR3P51677 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCR3P51677 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCR3P51677 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCR3P51677 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCR3P51677 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCR3P51677 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCR3P51677 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCR3P51677 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCR3P51677 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCR3P51677 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCR3P51677 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCR3P51677 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCR3P51677 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCR3P51677 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCR3P51677 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCR3P51677 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCR3P51677 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCR3P51677 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCR3P51677 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCR3P51677 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCR3P51677 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCR3P51677 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCR3P51677 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCR3P51677 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCR3P51677 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCR3P51677 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCR3P51677 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCR3P51677 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCR3P51677 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCR3P51677 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCR3P51677 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCR3P51677 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCR3P51677 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCR3P51677 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCR3P51677 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCR3P51677 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCR3P51677 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCR3P51677 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCR3P51677 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCR3P51677 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCR3P51677 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCR3P51677 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCR3P51677 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCR3P51677 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCR3P51677 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCR3P51677 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCR3P51677 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCR3P51677 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCR3P51677 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCR3P51677 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCR3P51677 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCR3P51677 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCR3P51677 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCR3P51677 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCR3P51677 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCR3P51677 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCR3P51677 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCR3P51677 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCR3P51677 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCR3P51677 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCR3P51677 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCR3P51677 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCR3P51677 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCR3P51677 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCR3P51677 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCR3P51677 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCR3P51677 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCR3P51677 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCR3P51677 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCR3P51677 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCR3P51677 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCR3P51677 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCR3P51677 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCR3P51677 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCR3P51677 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCR3P51677 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCR3P51677 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCR3P51677 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCR3P51677 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCR3P51677 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCR3P51677 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCR3P51677 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCR3P51677 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCR3P51677 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCR3P51677 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCR3P51677 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms